Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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NPRL3Q12980 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NPRL3Q12980 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NPRL3Q12980 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NPRL3Q12980 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NPRL3Q12980 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NPRL3Q12980 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NPRL3Q12980 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NPRL3Q12980 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NPRL3Q12980 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPRL3Q12980 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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