Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH17Q12864 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH17Q12864 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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