Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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