Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAAP100Q0VG06 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAAP100Q0VG06 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms