Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms