Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms