Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms