Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms