Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms