Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms