Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms