Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSF1Q00613 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms