Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms