Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFAMQ00059 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms