Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF3P78545 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms