Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms