Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms