Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BACE1P56817 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BACE1P56817 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BACE1P56817 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BACE1P56817 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BACE1P56817 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BACE1P56817 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BACE1P56817 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BACE1P56817 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms