Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRISP1P54107 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms