Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MVDP53602 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVDP53602 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVDP53602 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVDP53602 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MVDP53602 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MVDP53602 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVDP53602 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms