Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMSP52788 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMSP52788 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMSP52788 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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