Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR4P51679 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR4P51679 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms