Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA4P51532 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms