Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A3P48751 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms