Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms