Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCCP43146 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCCP43146 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCCP43146 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCCP43146 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCCP43146 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCCP43146 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCCP43146 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCCP43146 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCCP43146 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCCP43146 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms