Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6P35125 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6P35125 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6P35125 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6P35125 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms