Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTX2P32243 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms