Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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