Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms