Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CD34P28906 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD34P28906 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD34P28906 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms