Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms