Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms