Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APEX1P27695 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APEX1P27695 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APEX1P27695 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APEX1P27695 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APEX1P27695 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APEX1P27695 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APEX1P27695 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
APEX1P27695 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APEX1P27695 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APEX1P27695 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APEX1P27695 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APEX1P27695 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms