Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRBP23467 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRBP23467 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRBP23467 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRBP23467 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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