Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALB2P22676 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALB2P22676 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALB2P22676 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALB2P22676 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALB2P22676 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALB2P22676 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALB2P22676 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALB2P22676 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms