Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms