Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHP20396 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHP20396 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHP20396 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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