Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGCP20142 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGCP20142 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGCP20142 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGCP20142 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGCP20142 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGCP20142 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGCP20142 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGCP20142 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms