Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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