Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME1P15531 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME1P15531 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME1P15531 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms