Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms