Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL2P13500 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCL2P13500 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CCL2P13500 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCL2P13500 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CCL2P13500 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms