Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms