Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLBP1P12271 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms