Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RGPD2P0DJD1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms