Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLDN9O95484 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLDN9O95484 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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