Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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