Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms