Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLIT2O94813 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms